Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VGFO15240 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGFO15240 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VGFO15240 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VGFO15240 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms