Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C2AO00443 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3C2AO00443 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms