Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIP1O00291 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms