Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms