Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms