Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms