Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms