Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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