Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms