Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SNX13Q9Y5W8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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