Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms