Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC2Q9Y235 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms