Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVW-1Q9UQF0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms