Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX6Q9UPM6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX6Q9UPM6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX6Q9UPM6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX6Q9UPM6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX6Q9UPM6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms