Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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USP18Q9UMW8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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