Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD4Q9ULV1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms