Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms