Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms