Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms