Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms