Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms