Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms