Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP2Q9UDT6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms