Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK4Q9UBT3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms