Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms