Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms