Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms