Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms