Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMOD2Q9NZR1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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