Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms