Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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