Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms