Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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