Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B1Q9NRF2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms