Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP26Q9NRE1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MMP26Q9NRE1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms