Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms