Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms