Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms