Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms