Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms