Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6CQ9HCJ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms