Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC3GQ9HC16 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms