Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD3Q9H7E2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms