Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms