Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AL445072.1-201ENST00000438994 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC078899.4-201ENST00000593952 1113 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms