Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCL11BQ9C0K0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms