Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT23Q9C075 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms