Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms