Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSD3Q9BZ95 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSD3Q9BZ95 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSD3Q9BZ95 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms