Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms